由于农业大棚进行农业种植时能够减少天气影响，能够种出反季蔬果，在市场上卖得高价，再加上政府对此有补贴政策，因此，农业大棚的使用受到了很多农民的青睐。但是在大棚的使用上，却出现了很多问题。
【1】生产不稳定，风险大
冬季蔬果生产中的亚低温影响或低温寒害与冻害以及夏季室内气温过高，这不仅影响蔬果的产量与质量，同时还影响到生产的稳定性。
【2】劳动生产率低
目前，我国棚室蔬菜的劳动生产率仍然很低，就普通生产来说，每人仅经营一亩田地左右，其劳动生产率仅是日本的1/20，美国的1/40。造成设施农业劳动生产率不高的原因有很多，其中主要是温室大棚规模不大、设施相对简陋、抵御自然灾害的能力较差、环境控制和生产管理的机械化程度比较低、生产水平落后、生产者素质和技术水平低下。
【3】经济效益下降
随着温室大棚面积的任意增加，我是大棚农产品出现相对过剩状态，由此造成产品季节差价不断缩小，价位不断降低，经济效益逐年下降。造成这种现象的主要原因是区域化生产特点不强；无序竞争日趋严重；温室大棚生产种类单调，生产盲目；市场体系不健全，缺乏有序组织，国际市场份额仍然很小。
【4】产品质量不高
产品的商品品质和营养品质都不高。目前，虽然温室大棚产品人均占有量较高，但其中无公害产品仍然较少。造成这种状况的主要原因是缺乏优质优价的市场机制；生产上缺乏无公害产品生产标准；生产者缺乏无公害生产意识和技术。近年来，虽然各级政府非常重视无公害农产品的生产，但是与之配套的一些措施和政策仍然需要更好地落实，有关技术仍然需要不断的研究与完善。
【5】产量低
我国的温室大棚平均亩产量只有5000千克左右，仅为发达国家的1/8，但我国温室大棚总量却占全球70%。
我国温室大棚数量占全球的70%，这表明很多农民已经意识到农业大棚种植带来的商机，但是我们的农业大棚生产效益却远远比不上发达国家。未来，在世界设施农业高速发展的背景下，提高劳动生产率，增加经济效益，提高产品质量与产量将成为必然。
